Фамилия Казникова — женская форма, а её мужской вариант Казников. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Казник. Чтобы понять его происхождение, нужно разобрать корень «казн-». В древнерусском языке слово «казна» означало сокровищницу, имущество, денежные средства. Соответственно, «казник» — это человек, имеющий отношение к казне: казначей, хранитель княжеской или государственной сокровищницы, сборщик податей. Такая должность была важной и доверенной, поэтому прозвище могло закрепиться за человеком, который служил при казне или ведал деньгами.

Вторая, менее очевидная версия, отсылает к глаголу «казнить». В этом случае Казником могли прозвать человека сурового, скорого на расправу, либо того, кто исполнял приговоры — палача. Однако эта гипотеза слабее: прозвища от глагола «казнить» встречаются реже, и они обычно имеют более конкретную огласовку (например, Казнитель). Слово «казна» в быту было распространено шире, и производные от него фамилии встречаются чаще.

Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -ник дало суффиксальное притяжательное прилагательное Казников (чей? — сын Казника). Суффикс -ов указывает на принадлежность к роду. Фамилия недворянская, скорее всего, принадлежала крестьянам или посадским людям, среди которых должность казначея или писца при казне была вполне реальной. В документах XVII–XVIII веков можно встретить упоминания крестьян Казниковых в центральных и северных губерниях России, что подтверждает связь с деловой, а не криминальной сферой. Сегодня фамилия редкая, сосредоточена в основном в европейской части страны.