Фамилия Кекендженова звучит необычно для русского уха, и это подсказка: её корни лежат далеко за пределами славянского мира. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского происхождения, а точнее — карачаево-балкарского или ногайского. Основа «Кекендж» восходит к мужскому имени Кекендж (варианты — Кекенч, Кёкенч). В тюркских языках это имя имеет прозрачную этимологию: оно образовано от слова «кёк» (небо, синий, зелёный) с уменьшительно-ласкательным суффиксом «-ендж». Таким образом, имя Кекендж можно перевести как «небесный», «голубоглазый» или «зеленоватый» — в зависимости от контекста, но всегда с оттенком нежности или принадлежности к чему-то чистому, высокому.

Суффикс «-ова» в окончании — типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность. В данном случае он был добавлен к тюркской основе при русификации фамилии, что часто происходило в XIX–XX веках при записи в метрические книги или паспорта. Получается, что Кекендженова — это «дочь (или жена) Кекенджа». Мужской вариант фамилии — Кекендженов.

География фамилии узкая. Носители сосредоточены в основном в Карачаево-Черкесии, Кабардино-Балкарии, а также среди карачаево-балкарской диаспоры. Встречаемость фамилии невысокая, что говорит о её локальном характере: она могла возникнуть в одном конкретном роде или ауле. В дореволюционные времена предки носительницы фамилии были, вероятно, скотоводами или земледельцами, а само имя Кекендж могло быть дано ребёнку по внешнему признаку (светлые глаза) или как пожелание быть «чистым, как небо».

Спорных версий здесь немного. Иногда пытаются связать корень с калмыцким «кекен» (козлёнок) или монгольским «хөх» (синий), но это натяжка: ареал фамилии чётко указывает на Северный Кавказ, а не на степи. Правдоподобнее всего именно антропонимическая модель: личное имя → фамилия.