Фамилия Кеклис, по одной из версий, происходит от имени Кекле, в основе которого лежит литовское слово kekele – «кисточка, веточка». Так родители могли ласково называть маленького ребенка. Согласно другой версии, фамилия Кеклис образована от прозвища Кекле, связанного с литовским глаголом keikti – «ругать, бранить», «кричать». В этом случае фамилия может указывать на особенности характера или громкий голос родоначальника.