Фамилия Кекуатов — наглядный пример того, как тюркское имя или прозвище обросло русским фамильным суффиксом и закрепилось в документах. Основа здесь — «Кекуат», а суффикс «-ов» указывает на принадлежность: «чей?» — Кекуатов, то есть потомок человека по имени или прозвищу Кекуат.

Само слово Кекуат (встречаются варианты Кеккуат, Кеккуат) — сложное тюркское образование. Первая часть «кек» (или «кёк») в тюркских языках означает «синий», «небесный», «голубой», а также «корень» или «основа». Вторая часть «уат» (или «уад») — производное от арабского «вахдат» (единство) или тюркского «ат» (имя, конь). Наиболее вероятное толкование — «имеющий небесную (божественную) основу» или «крепкий, как синий камень». Встречается также версия, что Кекуат — это искажённое «Кек-байат» (синее богатство), но она менее убедительна из-за редукции согласных.

Географически фамилия Кекуатов тяготеет к Поволжью и Приуралью, особенно к территориям бывшего Казанского ханства — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области. В этих краях фамилия фиксируется у татар и башкир, принявших православие в XVI–XVIII веках. При крещении тюркские имена переходили в фамилии без изменений, только с добавлением русского суффинкса. Поэтому предки Кекуатовых могли быть служилыми татарами, перешедшими на русскую службу, или крещёными мурзами.

Редкость фамилии объясняется тем, что имя Кекуат не было широко распространено даже в тюркской среде — это скорее локальное прозвище или имя, данное по какому-то яркому признаку (например, человек с синими глазами или родившийся в «синий» день недели). В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается спорадически, в основном в Казанской и Уфимской губерниях.

Любопытно, что ударение в фамилии плавающее: в татарском произношении акцент падает на последний слог (Кекуато́в), а в обрусевшей среде — на второй (Кекуа́тов). Это обычная история для фамилий, перешедших из тюркских языков: русское ухо перетягивает ударение на более привычное место.