Фамилия Керепанака — это вариант известной русской фамилии Черепанов, только записанный латиницей (Cerepanaka) и затем переданный кириллицей в непривычной форме. В основе лежит прозвище Черепан. В старину черепаном называли горшечника, гончара — того, кто делал посуду из глины. Но это не единственная версия. В новгородских говорах слово «черепаны» означало «мужские сапоги с грубыми, сыромятными голенищами». Так что прозвище могло указывать на сапожника, который шил такую грубую обувь. Оба занятия — ремесленные, так что фамилия относится к числу «профессиональных» именований: предок носителя фамилии Керепанака мог быть либо гончаром, либо мастером по изготовлению обуви.

Есть и третья, топонимическая версия. Прозвище Черепан иногда давали выходцу из города Череповца (Вологодская область). Название города, по мнению исследователей, происходит от слияния двух древнерусских слов: «черепь» (возвышенное место, возвышенность) и «весь» (деревня). То есть Череповец — это «деревня на возвышенности». Если предок был оттуда родом, его могли прозвать Черепаном по месту жительства.

Сама форма Керепанака — результат транслитерации: латинское Cerepanaka при обратном переводе на русский дало не «Черепанова» или «Черепан», а именно «Керепанака». Такое написание встречается у потомков эмигрантов или у носителей, чья фамилия была записана в документах на латинице, а затем переписана кириллицей без учёта исходного звучания. По сути, это та же фамилия Черепанов, но в редком графическом варианте.