Фамилия Керхеснер — редкий случай, когда её основа почти наверняка указывает на конкретное место в Германии, а не на профессию или личное имя. В основе лежит немецкий топоним Керхес (Kerches) или Кирхес (Kirches), который, в свою очередь, восходит к слову Kirche — «церковь». Суффикс -нер (-ner) в немецких фамилиях — типичный указатель на выходца из определённой местности, то есть носитель фамилии — это «человек из Керхеса».

Географических точек с названием Керхес в немецкоязычном мире немного, но они есть. Наиболее вероятный ориентир — населённые пункты в землях Гессен или Бавария, где встречаются микротопонимы, образованные от диалектных форм слова «церковь». Важно, что написание через «е» после «р» (Керхес, а не Кирхес) указывает на южнонемецкий или австрийский диалектный вариант произношения, где гласный звук редуцировался. Таким образом, предок носителя фамилии Керхеснер — это переселенец из деревни, названной в честь местной церкви.

Фамилия не славянская и не искусственная, а чисто немецкая по происхождению. В Россию она могла попасть с волнами немецких колонистов в XVIII–XIX веках, когда в Поволжье, Причерноморье или на Волыни оседали выходцы из южных и центральных земель Германии. В этом случае Керхеснер — не просто фамилия, а метка, сохранившая название крошечного родного села, которое исчезло или сменило имя ещё до массовых миграций.

Словообразовательная модель проста: топоним + суффикс принадлежности. Суффикс -нер в немецкой ономастике аналогичен русскому -ский в фамилиях вроде Московский или Тверской, но с той разницей, что он не указывает на дворянское происхождение, а лишь на географию. Встречаются варианты написания Кирхеснер или Кирхеснер, но форма с «е» в первом слоге — более архаичная и диалектная, что делает её ценной для историков языка.

Других версий — от профессии или прозвища — для этой фамилии нет. Случайных совпадений с корнями, означающими «черкес» или «керчь», не существует: это ложные созвучия, которые не выдерживают проверки по законам немецкой фонетики и словообразования.