Фамилия Керкеснер — редкий пример фамилии, которая почти наверняка пришла в русский обиход не из славянских земель, а из немецкоязычной или еврейской (ашкеназской) среды. Её основа и суффикс указывают на германскую модель образования, где -er — типичный суффикс деятеля или жителя.

Вероятнее всего, Керкеснер — это немецкая фамилия, записанная кириллицей. Её ядро — «Керкес» (Kerkes). В немецком языке это слово может восходить к названию профессии или прозвищу. Одна из версий связывает её с диалектным словом «Kerker» (тюрьма, темница) или «Kerkermeister» — тюремщик. Тогда Керкеснер — это «тот, кто работает в тюрьме» или «надзиратель». Однако более убедительной выглядит версия происхождения от восточно-немецкого или силезского диалектного варианта слова «Kirche» (церковь). В этом случае «Kerkes» могло означать «церковный служка», «пономарь» или «сторож при церкви». Суффикс -ner добавляет значение принадлежности к месту или роду занятий, аналогично русским суффиксам -щик или -ник.

Вторая, не менее вероятная гипотеза — еврейское происхождение. Фамилии на -ер, образованные от названий городов или профессий, широко распространены среди ашкеназов Восточной Европы. Керкеснер могло быть топонимической фамилией: от названия местечка Керкес (Kerkes) или его окрестностей. Без точного картографического подтверждения сложно сказать, какой именно населённый пункт имеется в виду, но логика «фамилия по месту, откуда человек родом» здесь работает безупречно.

Особенность этой фамилии — её графическая и фонетическая неустойчивость при переходе в русский язык. В документах XIX — начала XX века она могла писаться как Керкезнер, Керкеснеръ, а иногда и как Керкеснер с двойным «с». Это типично для «переселенческих» фамилий: писарь записывал на слух, а немецкое «z» или «s» передавалось по-разному. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к мещанам или ремесленникам — людям, жившим в городах или местечках черты оседлости, а не к крестьянам или дворянам.

Таким образом, если ваш предок носил фамилию Керкеснер, он с высокой долей вероятности был либо выходцем из немецких колоний (ремесленник, церковнослужитель), либо евреем из местечка с похожим названием. Точную версию можно установить только по региону бытования фамилии: если корни ведут в Поволжье или Причерноморье — скорее немецкая; если в западные губернии (Волынь, Подолье, Бессарабия) — скорее еврейская.