Фамилия Киркеснер — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение стоит искать не в славянских корнях, а в немецком или еврейском (ашкеназском) именослове. Это не типичная русская фамилия с суффиксом -ов или -ин, а скорее всего, результат миграции и адаптации западноевропейской фамилии на восточнославянской почве. Если вы её носитель, ваши предки, вероятно, были выходцами из немецкоязычных земель или еврейскими переселенцами, которые оказались в Российской империи в XVIII–XIX веках.

Основа фамилии — «Киркес» — восходит к немецкому слову Kirche («церковь») или к названию города Кирхгайм (Kirchheim). Второй элемент «-нер» — типичный немецкий суффикс, обозначающий принадлежность к месту или профессии. Таким образом, Киркеснер мог означать «человек из Кирхгайма» или, что более вероятно, «церковный служитель», «тот, кто работает при церкви». В еврейской среде такие фамилии часто давали по названию синагоги или общины, либо как прозвище кантора или служки.

Второй, менее распространённый вариант — связь с польским или украинским диалектным словом «керкес» (вид грубой ткани или одежды). В этом случае фамилия могла бы указывать на ремесленника-ткача или торговца сукном. Однако эта версия слабее, так как суффикс «-нер» нехарактерен для славянских языков, и фамилия явно несёт германский отпечаток.

В Российской империи фамилия Киркеснер встречалась в черте оседлости (Волынская, Подольская губернии), а также среди немецких колонистов Поволжья. В советское время носители разъехались по стране, но фамилия осталась очень малочисленной — по переписям, в России сегодня её носят не более нескольких сотен человек. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Ки́ркеснер, хотя в быту встречаются варианты с ударением на последний слог — под влиянием немецкого произношения.

Если хотите узнать точнее, кем были ваши предки — посмотрите на географию: немецкие Киркеснеры чаще были ремесленниками или крестьянами-колонистами, а еврейские — торговцами или служащими при общине. В любом случае, фамилия не крестьянская и не дворянская, а городская, мещанская или купеческая.