Фамилия Киркин образована от прозвища Кирка. Скорее всего, оно связано с нарицательным «кирка», то есть мотыга. Очевидно, Киркой называли человека, который использовал этот инструмент для земляных, огородных или каменных работ. В этом случае данное прозвище относится к числу так называемых «профессиональных» именований, указывавших на род занятий предка. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе фамилии лежит краткая форма крестильного имени Кирилл — Кирка. Само же имя имеет греческое происхождение и переводится на русский язык как «господин, владыка». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кирка, со временем получил фамилию Киркин.