Фамилия Керстенс — почти наверняка не русская, а западноевропейская, и её происхождение напрямую связано с личным именем. В основе лежит христианское имя Керстен — немецкая или скандинавская форма имени Христиан (Christian), которое, в свою очередь, восходит к латинскому Christianus — «последователь Христа». Прибавка -с на конце — это типичный для нидерландского, фламандского, а также для северогерманского ареала патронимический суффикс. Керстенс буквально означает «сын Керстена», то есть «Христианович».

Географически фамилия плотнее всего привязана к Нидерландам (особенно к провинциям Фрисландия и Гронинген) и к Фландрии (север современной Бельгии). В немецких землях она встречается реже, чаще в форме Kersten без конечного -s. В Россию эта фамилия могла попасть несколькими путями: с переселенцами-меннонитами в эпоху Екатерины II, с прибалтийскими немцами, служившими в империи, или с голландскими мастерами, которых приглашали при Петре I.

Что касается ударения, то в русском языке фамилию обычно произносят с ударением на первый слог: Ке́рстенс. В оригинале, в нидерландском, ударение падает на первый слог, но произносится он с долгим звуком, близким к «эй»: Keirstens.

В отличие от многих русских фамилий, у Керстенс нет суффикса принадлежности (-ов, -ев, -ин), который указывал бы на крестьянское или дворовое происхождение. Это чистая западная патронимическая модель, которая закрепилась как наследственная фамилия уже в XVI-XVII веках, когда фамилии в Нидерландах стали фиксироваться и передаваться по мужской линии без изменений. Поэтому искать в этой фамилии указание на ремесло или прозвище предка не стоит — она говорит только об имени отца, которое было распространённым церковным именем.