Фамилия Хабрахабр — редчайший случай в русской ономастике. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, а корень не похож ни на одно славянское слово. По сути, перед нами не патроним (от имени отца) и не прозвище по ремеслу, а скорее всего, позднее искусственное образование или результат искажения при переписи.

Наиболее вероятная версия — фамилия восходит к тюркскому или арабскому имени Хабр (встречается у татар и башкир) с удвоением корня. «Хабр» в арабском означает «весть», «известие», а также «учёный», «знающий». Повтор «Хабрахабр» мог возникнуть как усилительная форма: «весть вестей» или «великий знающий». Такая модель редка, но встречается в тюркских языках (сравните с именами типа Бахрамбахр). Скорее всего, предок носителя фамилии был грамотным человеком — муллой, писарем или толкователем.

Вторая версия, менее правдоподобная, — фамилия могла возникнуть как прозвище от диалектного «хабр» (в некоторых говорах — «обманщик», «плут»). Удвоение в таком случае носило бы экспрессивный характер: «самый что ни на есть хабр». Однако против этой гипотезы говорит отсутствие фиксации такого прозвища в исторических документах.

Географически фамилия Хабрахабр почти не встречается в старых ревизских сказках и метрических книгах — это указывает на её позднее происхождение, возможно, в XIX–XX веках. Единичные носители могли появиться в Поволжье (в татарской среде) или на Северном Кавказе, где сильны арабские заимствования.

Словообразовательная модель нестандартна: полное совпадение корня в двух частях без соединительной гласной — явление, характерное скорее для сложных восточных имён, чем для русских фамилий. Если бы фамилия была русской по форме, мы бы ожидали суффикс: Хабрахабров или Хабрахабрин. Но его отсутствие говорит о том, что фамилия застыла в виде прозвища или имени, не подвергшегося русификации.

Таким образом, Хабрахабр — это, вероятно, тюрко-арабское по происхождению имя-удвоение, означающее «ведун» или «знаток». Носители такой фамилии могли быть потомками сельских учителей, мулл или переписчиков книг.