Фамилия Халимханов — один из тех случаев, когда географическое распространение сразу подсказывает направление поиска. Она почти не встречается в центральной России, зато прочно привязана к Северному Кавказу, в первую очередь к Дагестану и Чечне. Это не случайность: фамилия образована по тюрко-персидской модели, которая характерна для народов, исторически испытавших влияние исламской культуры и тюркских языков.

В основе лежит составное арабское имя Халимхан. Первая часть — Халим (от арабского حليم — «мягкий», «кроткий», «терпеливый»; один из эпитетов Аллаха в исламе — Аль-Халим, «Снисходительный»). Вторая часть — хан — тюркский титул, означавший правителя, владыку. В именах собственных «хан» давно утратил прямое значение властителя и превратился в уважительный компонент, подчеркивающий достоинство, знатность или просто благозвучие. Таким образом, личное имя Халимхан можно перевести как «снисходительный правитель» или «терпеливый владыка», хотя в быту оно воспринималось как цельное, престижное имя.

Русский суффикс -ов, добавленный к восточному имени, — это стандартный способ адаптации нерусских фамилий в документах Российской империи. Он отвечал на вопрос «чей?»: Халимханов сын, потомок Халимхана. Фамилия закрепилась в XIX — начале XX века, когда горские народы Кавказа массово получали фамилии по отцу при переписях и военном учёте.

Стоит отметить, что в самой Чечне и Дагестане исконная форма фамилии могла звучать иначе — без русского окончания, просто как Халимхан. Но в российских метриках и паспортах прижился именно вариант Халимханов. Это типичная история для фамилий, которые прошли через бюрократическую машину империи: основа осталась та же, а окончание подсказывает, что предок был мусульманином и жил на восточной окраине государства. Других версий происхождения — от прозвища или названия ремесла — для этой фамилии не существует, корень здесь исключительно именной.