Фамилия Хальманенко — один из тех случаев, когда славянская модель фамилии (суффикс -енко) накладывается на основу, звучащую совершенно неславянски. Это сразу подсказывает главное: перед нами украинская или южнорусская фамилия, образованная от прозвища или имени иностранного происхождения. Суффикс -енко в XVII–XVIII веках был типичен для Поднепровья, Слобожанщины и Запорожья; он означал «сын» или «потомок» человека, названного в основе.

Основа «Хальман» — ключ к разгадке. Скорее всего, это немецкая или еврейская фамилия Хальман (Halman, Hallmann). В немецком языке она могла быть составной: «Halle» (соль) или «Halm» (стебель, соломина) плюс «Mann» (человек). То есть прозвище могло означать «солевар» или «человек из Галле». Однако в украинской среде такое прозвище чаще давали не по ремеслу, а по происхождению: так могли называть немца-колониста, приглашённого на юг России в XVIII–XIX веках, или выходца из еврейского местечка. В любом случае, Хальманенко — это «потомок Хальмана».

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: «Хальман» — искажённое тюркское прозвище. В языках кочевников слово «халман» могло означать «остаток» или «слабоумный», но для фамилии это слишком уничижительное значение, и в документах оно почти не встречается. Поэтому немецкий корень остаётся основным.

Фамилия редкая. В современных реестрах Украины и России она встречается единично, чаще всего в Запорожской области и на юге Донбасса — там, где в XIX веке располагались немецкие колонии меннонитов. Носители фамилии, скорее всего, потомки обрусевших или украинизированных колонистов, которые получили типичную украинскую фамилию по отцу. В дворянских родословных книгах фамилия не значится: это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в быту, а не в канцелярии.