Фамилия Хамиджанов — яркий пример русского «русифицированного» варианта восточного имени. Её основа — арабское мужское имя Хамид, которое означает «восхваляющий», «прославляющий Бога». Это одно из имён, производных от корня х-м-д, того же, что и в имени Мухаммад. Сложность в том, что перед нами не просто Хамидов, а Хамиджанов. Вторая часть — «джан» — тюркский компонент, означающий «душа» или «дорогой, любимый». В Средней Азии, особенно в Узбекистане и Таджикистане, имена с элементом «джан» (Хамиджан, Каримджан, Ахмаджан) были ласкательной, уважительной формой. Таким образом, Хамиджан — это «дорогой Хамид» или «душа-Хамид».

Русский суффикс «-ов» превратил восточное составное имя в фамилию по стандартной модели, принятой в Российской империи для нерусских народов. Фамилия Хамиджанов, скорее всего, сформировалась в среде оседлого населения Средней Азии (узбеки, таджики) в конце XIX — начале XX века, когда начался массовый учёт населения и фиксация фамилий по русскому образцу. Носитель фамилии — потомок человека, которого звали Хамиджан. Географически фамилия наиболее частотна в Узбекистане, Таджикистане, а также среди выходцев из этих регионов в России.

С точки зрения словообразования, фамилия примечательна тем, что сохранила двойную «чужеродную» морфологию: арабский корень, тюркский аффикс и славянское окончание. Это не просто «сын Хамида» (как было бы в случае Хамидов), а «сын Хамиджана», что подчёркивает более личное, почти прозвищное происхождение от уменьшительно-ласкательной формы. Встречается также вариант написания Хамиджанов с одной «н» — Хамиджанов, но нормативным для русской орфографии считается двойное «н», так как суффикс «-ов» присоединяется к основе на «н» (Хамиджан).