Фамилия Хамисян — армянская по происхождению, что сразу видно по типичному суффиксу -ян, который в армянском языке указывает на принадлежность к роду или происхождение (буквально «из рода такого-то»). В русской среде такие фамилии часто получали окончание -ов или -ев, но Хамисян сохранила исходную армянскую форму. Основа фамилии — личное имя Хамис или прозвище, образованное от него.

Корень «Хамис» восходит к арабскому «хамис» (خميس), что значит «пятый» или «четверг» (пятый день недели в арабском календаре). В мусульманской традиции имя Хамис давали мальчику, родившемуся в четверг, либо как порядковое имя пятому ребёнку. У армян, исторически живших в тесном контакте с арабо-мусульманским миром (особенно в регионах Закавказья и Персии), такие имена заимствовались и адаптировались. Таким образом, Хамисян — это «потомок Хамиса», то есть человека с именем или прозвищем «Пятый» или «Четверговый».

С географической точки зрения, фамилия тяготеет к западным и южным областям исторической Армении — районам Вана, Муша, а также к армянским общинам Сирии и Ливана, откуда в XIX—XX веках шла эмиграция в Российскую империю. В современной России фамилия встречается редко, в основном у потомков армянских переселенцев. В отличие от русских фамилий на -ян, которые иногда возникали из тюркских корней (например, Багрян), Хамисян — случай чистого арабского заимствования через армянскую ономастику.

Интересная деталь: в армянских фамилиях суффикс -ян может также указывать на принадлежность к определённому роду или ремеслу, но в данном случае он работает как патронимический — по имени отца. То есть предок носителя фамилии был известен под именем Хамис, и его дети и внуки стали «Хамисянами». Это простой и прозрачный механизм, типичный для армянских фамилий, которые массово закрепились в XIX веке после реформы 1828 года, когда армяне Российской империи получили обязательные фамилии.

Если отбросить версию с арабским корнем, есть маловероятное предположение о связи с армянским словом «хамич» (խամիճ) — «сыроватый», «недозрелый». Но оно не выдерживает критики: фамилии от прилагательных с суффиксом -ян в армянском языке образуются редко, и смысл «потомок сыроватого» выглядит натянуто. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — арабское имя Хамис, пришедшее через армянскую среду.