Фамилия Хандутян — яркий пример армянской модели фамилии, которая сразу указывает на происхождение рода. Её основа — личное имя или прозвище Хандут, к которому добавлен типичный армянский патронимический суффикс -ян (в старой орфографии -янц). Этот суффикс означает «принадлежащий к роду такого-то» или «потомок кого-то», то есть Хандутян — это «потомок Хандута».

Само имя Хандут — сложное и редкое. Скорее всего, оно образовано от тюркского слова «хан» (властитель, правитель) и армянского уменьшительно-ласкательного суффикса -ут. В таком случае Хандут можно перевести как «маленький хан» или «князёк». Это не означает, что предок был реальным ханом: часто такие прозвища давали человеку с гордой осанкой, властным характером или просто в шутку, как знак уважения или иронии. В армянской ономастике встречаются и другие имена с компонентом «хан» (например, Ханзад, Ханмир), что говорит о многовековых контактах армян с тюркской и персидской культурой.

Географически фамилия Хандутян распространена среди армян, особенно из западных регионов исторической Армении (в частности, из области Сасуна и окрестностей Вана). В конце XIX — начале XX века носители фамилии могли переселиться в Восточную Армению, а затем и в диаспору. В России фамилия встречается, но редко, и почти всегда указывает на армянские корни.

Важно отметить, что в русском языке суффикс -ян не склоняется по падежам, а сама фамилия часто записывается без удвоения «н» (в отличие от некоторых других армянских фамилий, где возможны варианты). По социальному составу Хандутяне, как и большинство армянских родов, были крестьянами или ремесленниками, но отдельные ветви могли принадлежать к духовенству или торговцам. Точных данных о сословной принадлежности всех носителей нет, но ясно одно: фамилия не дворянская, а народная, образованная от живого прозвища.