Фамилия Ханмирзоев — это не отдельная родовая линия, а фонетический вариант более распространенной фамилии Ханмирзаев. Такое чередование конечных «а» и «о» в основе типично для тюркских языков, где гласные в безударной позиции звучат неотчетливо. На письме это закрепилось в виде двух равноправных форм, которые встречаются даже у близких родственников, разошедшихся по разным селам или областям.

Обе фамилии восходят к составному мужскому имени Ханмирза, которое образовано сращением двух самостоятельных основ. Первая часть — «хан» — в древнетюркско-татарском означала «повелитель», «властелин». Вторая — «мирза» — пришла из арабского языка (эмир-заде) и переводится как «сын эмира», «белая кость», то есть человек благородного, знатного происхождения. Складываясь вместе, эти основы давали имя с ярко выраженным пожелательным смыслом: родители нарекали сына Ханмирзой в надежде, что он вырастет достойным, уважаемым и влиятельным человеком.

Имена с компонентом «хан» были широко распространены у татар, азербайджанцев, народов Дагестана и других тюркоязычных групп. Они не обязательно указывали на реальное родство с ханами — скорее отражали мечту о высоком положении и достатке для ребенка. Точно так же и «мирза» в составе имени подчеркивало пожелание знатности, пусть и не всегда достижимой на практике.

Фамилия Ханмирзоев, как и Ханмирзаев, образована по классической модели притяжательного суффикса -ов/-ев, который в русской традиции закрепился за тюркскими именами. Первоначально такая форма отвечала на вопрос «чей ты?» и означала «сын Ханмирзы», «из рода Ханмирзы». Со временем патронимическое значение стерлось, и форма превратилась в наследственную фамилию, передающуюся из поколения в поколение.

Стоит заметить, что в написании с «о» (Ханмирзоев) чаще фиксируется у народов, где сильна азербайджанская или кумыкская языковая традиция, тогда как форма с «а» более характерна для татарской среды. Однако жесткой границы здесь нет: обе фамилии встречаются по всему постсоветскому пространству, и определить точную этническую принадлежность только по написанию невозможно. Для этого нужны генеалогические данные конкретной семьи.