Фамилия Ханждян — армянского происхождения. Её основа, «ханж», в армянском языке означает «кривой» или «согнутый». Соответственно, прозвище Ханж могли дать человеку с какой-либо физической особенностью: сутулому, хромому или тому, кто ходил сгорбившись. В армянских фамилиях часты прозвища, описывающие внешность или характер, и Ханждян — характерный пример такого именования.

Типичный армянский фамильный суффикс «-ян» (в ранних вариантах «-янц») восходит к древнему патронимическому показателю, означающему «из рода» или «принадлежащий». Таким образом, Ханждян — это «из рода Ханжа». Фамилия образована по продуктивной модели, распространённой по всей исторической Армении, поэтому её носители могут происходить из самых разных регионов — от Закавказья до армянских диаспор Ближнего Востока и России.

Встречаются также варианты написания с буквой «д» в середине — Хандждян, что связано с особенностями произношения в некоторых диалектах. В дореволюционных записях фамилию могли фиксировать на слух, отсюда возможны колебания в передаче звука «дж» русскими буквами. Но смысл корня остаётся неизменным.

Спорных версий происхождения у фамилии нет: значение «кривой» надёжно подтверждается армянской лексикой. Гипотезы о связи с арабским «хан» (постоялый двор) или тюркским «хан» (правитель) лингвистически слабы, так как суффикс «-ждян» нехарактерен для таких заимствований. Перед нами — чисто армянская фамилия, указывающая на конкретное прозвище предка.