Фамилия Хатункина образована от прозвища Хатунка — так в старину могли называть человека, имевшего отношение к слову «хатун». Корень здесь тюркский: hatun переводится как «госпожа», «государыня», «женщина» или «супруга хана». Сначала прозвище закрепилось за конкретным человеком, а уже его потомки со временем стали писаться Хатункиными. Модель типичная для русских фамилий: к основе на -а добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность роду, то есть «сын (или дочь) Хатунки».

Интересно, что прозвище с женским значением могло относиться и к мужчине. В тюркской среде «хатун» — титул знатной женщины, но в русских говорах прозвища нередко переосмыслялись: так могли прозвать человека за важность, степенность, а может, с иронией — за манеру держаться по-хозяйски. Не исключено, что прозвище дали по матери или бабушке, если женщина в семье пользовалась особым уважением и влиянием.

Суффикс -к- в основе Хатунка указывает на уменьшительно-ласкательную или обиходную форму — так могли звать кого-то в быту, среди своих. Подобные формы часто становились основой фамилий: Хатункин, Хатункина — это буквально «из семьи Хатунки».

Точное место и время возникновения рода Хатункиных без генеалогических изысканий назвать нельзя: фамилии в разных слоях населения закреплялись в разное время, где-то раньше, где-то позже. Но сама основа указывает на регионы, где русские долго соседствовали с тюркскими народами, — Поволжье, южные степи, Приуралье. Там подобные заимствования в прозвищах были обычным делом.

Отдельно стоит сказать, что фамилия Хатункина встречается реже, чем её мужской вариант Хатункин, и это естественно: женские формы фамилий в русской традиции — явление более позднее, связанное с изменением статуса женщины в документах и быту. Так что носительница фамилии Хатункина может с полным правом считать себя наследницей прозвища, которое когда-то звучало гордо — как обращение к госпоже.