Фамилия Херламотинов — редкий случай, когда на слух она звучит почти как иностранная, а по корню оказывается глубоко русской, но с неожиданным «греческим» следом. Если отбросить окончание -ов, которое прямо указывает на принадлежность («чей?» — Херламотинов), в основе лежит имя Херламотий. Это просторечная, народная форма канонического крестильного имени Харлампий.

Имя Харлампий пришло на Русь из греческого языка и означает «сияющий радостью» или «светлый». В народе его переделали на свой лад: вместо сложного «Харлампий» говорили Харлам, Харламоша, а в диалектах, где «а» после шипящих могло перейти в «е» (явление «еканья»), появился вариант Херлам. От него образовали полную форму Херламотий — по той же модели, что, например, Акакий превращался в Акатий. Суффикс -ин в фамилии не случаен: он присоединился к основе, оканчивающейся на -ий, и закрепился как Херламотинов, а не Херламотьев, что и создаёт впечатление необычности.

Фамилия эта — почти наверняка семинарская или священническая. В духовных училищах и семинариях XVIII–XIX веков было принято давать ученикам фамилии по церковным праздникам или по именам святых, причём часто в облагороженной, грецизированной форме. Харлампий — имя святого мученика, память которого чтится церковью. Семинарист, носивший в миру фамилию Попов или Иванов, мог получить «учёную» фамилию Харламов, Харлампиев или, в менее стандартном варианте, Херламотинов. Редкий суффикс -отинов указывает на искусственное, книжное происхождение: по аналогии с греческими формами (сравните: Парфений — Парфенотинов, но это уже крайняя редкость).

Географически фамилия могла закрепиться в центральных губерниях России, где были сильны семинарские традиции — например, в Рязанской, Тверской или Московской. Встретить её в крестьянской среде маловероятно: слишком она длинная и «учёная» для прозвища по ремеслу или внешности. Носители этой фамилии, скорее всего, потомки причётников, дьячков или священников, чьи предки получили её за партой духовного училища.

Итак, главное: Херламотинов — это не искажённая греческая или молдавская фамилия, а русская семинарская фамилия, образованная от народной формы имени Харлампий. Она говорит о том, что предок её носителя был человеком книжным, церковным, а сама фамилия — живое свидетельство того, как народное произношение и книжная традиция сплелись в одно слово.