Фамилия Хермойор — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение почти со стопроценттной уверенностью ведёт в Прибалтику или Скандинавию, а точнее — в немецкоязычную среду. Основа фамилии — немецкое слово Herr, что означает «господин», «хозяин». Вторая часть, Moyor, — искажённое Mayor (мэр, бургомистр) или немецкое Meier (управляющий имением, арендатор). Таким образом, исходное прозвище Herr Meier — «господин управляющий» или «господин мэр» — могло получить либо человек, занимавший такую должность, либо тот, кто служил у важного лица и получил прозвище по его титулу.

Написание «Хермойор» — результат русификации. В оригинале фамилия выглядела бы как Hermeier, Hermeyer или Hermayor. Фонетически «е» после «r» перешло в «о» (сравните: немецкое Meyer по-русски часто передаётся как Мейер, но в диалектах или при устной передаче могло дать «Мойер»). Суффикса -ов или -ин нет, то есть фамилия закрепилась в той форме, в которой её записали при переезде носителя в Российскую империю — скорее всего, среди остзейских немцев или шведов, живших в Прибалтике.

Географически фамилия Хермойор почти не встречается за пределами бывших прибалтийских губерний и, возможно, Финляндии. В России её носители — потомки переселенцев XVIII–XIX веков, которые могли быть лютеранами, городскими чиновниками или ремесленниками. Сословная принадлежность, скорее всего, мещанская или купеческая: «господин» в фамилии — не указание на дворянство, а отражение уважительного обращения к человеку на службе.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Гермайер, Хермайер, Мейер) показывает, что вариант на «-ойор» — один из самых редких и локальных. Он возник, вероятно, из-за особенностей письменной фиксации в польских или немецких канцеляриях, где букву «e» могли читать как «ё», а затем записать как «о». Никаких известных исторических личностей с такой фамилией нет, что только подтверждает её камерный, семейный характер.