Фамилия Хоббиходжина — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью совпадает с произношением, и это сразу выдаёт её нерусское происхождение. В русском языке нет корня «хобби-», а суффикс «-ходж-» указывает на восточное, скорее всего, тюркское или персидское влияние. Перед нами фамилия, которая образована от личного имени или прозвища, а не от названия ремесла или места.

Разберём основу. Первая часть — «Хобби» — может быть искажённым вариантом тюркского «хобби» (уважение, почёт), но гораздо вероятнее, что это адаптация арабского «хабиб» (любимый, друг). Вторая часть — «ходжа» — классический восточный титул, означающий «господин», «наставник», «учитель» или «купец». В Средней Азии и на Кавказе «ходжа» часто указывало на потомков пророка Мухаммеда или просто на уважаемого человека. Таким образом, исходное имя или прозвище «Хобби-ходжа» могло означать «любимый господин» или «уважаемый друг».

Формант «-ина» в конце — это русский патронимический суффикс, который в женском роде означает «принадлежащая кому-то». В мужском варианте фамилия звучала бы как Хоббиходжин. Такая модель типична для русификации нерусских фамилий: к основе на гласный или мягкий согласный добавляли -ин, а не -ов. Например, так появились фамилии Каримов, Рашидов, но и Ходжин. В данном случае суффикс «-ин» присоединили к уже сложному имени «Хоббиходжа», что говорит о позднем оформлении фамилии, вероятно, в XIX — начале XX века, когда представители народов Средней Азии или Кавказа получали паспорта и им записывали фамилию по отцу.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где был распространён титул «ходжа»: Узбекистан, Таджикистан, отчасти Азербайджан и Дагестан. Однако окончание «-ина» и женская форма указывают, что носительница, скорее всего, живёт в русскоязычной среде — в России или среди русскоязычной диаспоры. Уникальность фамилии в том, что она скрещивает восточную почтительную конструкцию с чисто русским грамматическим оформлением, что делает её редким лингвистическим гибридом. Предки носительницы, судя по всему, были людьми уважаемыми — возможно, торговцами или духовными лицами, а сама фамилия закрепилась за одним родом, а не стала массовой.