Фамилия Хорбухонов — редкий случай, когда основа слова не имеет очевидных параллелей в русском языке, а значит, почти наверняка происходит из другого языкового ареала. Строение фамилии указывает на её тюркское или монгольское происхождение, и географически она тяготеет к Бурятии, Забайкалью или Якутии.

Разбираем словообразовательную модель. Суффикс -ов (в форме Хорбухонов) — это русский патронимический формант, который «пришили» к нерусской основе при оформлении фамилии по русскому образцу. Сама основа — «Хорбухон». В ней просматривается корень «хорб» или «хорбу», характерный для бурятского и монгольского языков. В бурятском языке слово «хорбо» или «хорбуу» может означать «кнут», «плеть» или нечто, связанное с изгибом, дугой. Суффикс -хон в бурятском — уменьшительно-ласкательный или указывающий на принадлежность к чему-то (как русское -онок/-ёнок). Таким образом, «Хорбухон» буквально переводится как «маленький кнут» или «сын того, кто связан с кнутом». Это могло быть прозвище человека, который делал кнуты, пастуха, погонщика скота или даже шутливое имя ребёнка, которого называли «кнутиком» за худобу или вертлявость.

Версия с монгольским корнем «хор» (запрет, табу) менее вероятна, хотя в монгольских языках есть слово «хориг» (запрет) и «хорбуулах» (запрещать). В таком случае «Хорбухон» могло бы означать «тот, кто налагает запрет» — возможно, родовой старейшина или шаман, устанавливавший табу. Но связь с «кнутом» (орудием управления и наказания) выглядит более прямой и бытовой, а значит, правдоподобнее.

Интересная деталь: в отличие от множества фамилий на -ов, где ударение падает на последний слог или на основу, в фамилии Хорбухонов ударение, скорее всего, сохраняется на втором слоге — Хорбу́хонов. Это выдает её иноязычную природу: носители не «обрусели» ударение, оставив его таким, как в исходном прозвище. Первые носители фамилии, вероятно, были бурятскими или якутскими скотоводами, получившими фамилию при крещении или при советской паспортизации в начале XX века. Сословно это были, скорее всего, инородцы (не дворяне и не крестьяне в классическом русском смысле), кочевники или оседлые «ясачные» люди, платившие дань пушниной или скотом.