Фамилия Хой в русском контексте — редкий случай, когда короткое слово ставит перед исследователем больше вопросов, чем длинная родословная. На первый взгляд, она может показаться иноязычной или искусственной, но её корни, скорее всего, уходят в народную речь и прозвища.

Самая вероятная версия связывает фамилию Хой с древнерусским глаголом «хоить» — заботиться, холить, лелеять, а также чистить, убирать. В северных и сибирских говорах «хоить» означало «обихаживать», «приводить в порядок». Соответственно, прозвище Хой мог получить человек опрятный, рачительный хозяин или, наоборот, тот, кто чрезмерно пекся о своём внешнем виде. В пользу этой версии говорит наличие однокоренных фамилий Хойлов, Хойнов, а также фамилий с тем же корнем, но другим суффиксом — Хоин, Хойков.

Суффикса в фамилии нет. По модели образования она относится к так называемым «неоформленным» фамилиям, которые закрепились в виде чистого прозвища без патронимических суффиксов -ов/-ев или -ин. Это нетипично для центральной России, но встречается на Украине, в Белоруссии и в южнорусских областях, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений. Встречается фамилия и у коми-зырян, где слово «хой» имеет собственное значение (например, «тень» или «дух»), что не исключает параллельного, независимого происхождения у разных народов.

Вторая, менее распространённая версия отталкивается от значения слова «хой» как «защита», «приют» или «убежище» (от того же корня, что и «похороны» — «схоронить»). В этом случае прозвище могло даваться приёмышу или человеку, который дал кому-то кров. Однако это значение в языке почти утрачено, и лингвисты считают его менее вероятным для фамилии.

Географически фамилия Хой не привязана к какому-то одному региону, но чаще встречается в Краснодарском крае, Ростовской области и на Украине. Носители фамилии, как правило, не принадлежали к дворянству — это крестьянские или казачьи роды, где фамилия закрепилась в XVIII–XIX веках при переписях. Из-за своей краткости и необычного звучания фамилия Хой иногда воспринимается как иностранная (польская, немецкая или даже корейская), но для русской ономастики это скорее исключение, подтверждающее правило: чем короче фамилия, тем древнее и прозрачнее может быть её прозвищная основа.