Фамилия Хожбекян — яркий пример армянской модели образования фамилий, которая почти всегда даёт ключ к пониманию происхождения. Основа фамилии — мужское личное имя Хожбек. В армянском языке оно составное: первая часть «хож» восходит к тюркскому «ходжа» (господин, хозяин, учитель, а в прошлом — также почётный титул), вторая — «бек» (тюркский титул знати, князь). Таким образом, Хожбек означает «господин-бек» или «уважаемый бек» — имя-титул, указывающее на высокое положение или стремление подчеркнуть родовитость.

Фамильный суффикс -ян (в старой орфографии -янц) — самый распространённый в армянской ономастике. Он указывает на принадлежность: «Хожбекян» буквально переводится как «из рода Хожбека» или «потомок Хожбека». Такая модель сложилась в Закавказье примерно к XVII–XVIII векам, когда фамилии стали передаваться по наследству. Интересно, что в русских документах XIX века армянские фамилии на -ян часто записывали с окончанием -ов (-ев), но вариант Хожбекян сохранил исконную форму, что говорит о поздней или непереоформленной фиксации.

Географически фамилия тяготеет к восточноармянскому ареалу — территории современной Армении, Нагорного Карабаха и соседних регионов. Встречаются также написания Хожбекянц (с архаичным суффиксом принадлежности) и Хошбекян (под влиянием диалектного произношения, где «ж» переходит в «ш»). Носители фамилии, скорее всего, происходят из среды, где тюркские имена и титулы были в ходу среди армянского населения — это характерно для периода тесного культурного взаимодействия в Закавказье. Прямых указаний на сословную принадлежность нет, но составное имя с двумя титулами намекает на то, что предок мог быть не рядовым крестьянином, а человеком, имевшим вес в общине или связанным с местной знатью.