Фамилия Худовец — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не скрывает своего смысла. Корень «худ-» в русских говорах означал не только «плохой», но и «тощий», «слабый», «некрасивый». Однако в фамилии Худовец интереснее всего суффикс. Вместо привычного по всей России -ов (Худов) или -ин (Худин) здесь стоит -ец. В восточнославянской ономастике этот суффикс часто указывает на географическое происхождение: так называли выходца из определённого места. Вероятно, Худовец — это человек, прибывший из села или деревни с названием Худово, Худовка или Худовцы. Такие топонимы встречаются на Украине и в Белоруссии, особенно в Черниговской и Гомельской областях. Получается двойная мотивация: поселение само могло получить имя от первого поселенца по прозвищу Худой, а его жителей уже называли Худовцами.

Менее вероятна, но возможна версия, что -ец — это уменьшительный суффикс, и тогда Худовец означало «сын Худого» или «маленький Худой». Такой способ образования фамилий характерен для польской и западноукраинской традиции (сравните с фамилиями типа Ивановец, Петровец). В этом случае фамилия Худовец могла появиться в тех регионах, где смешивались русские, украинские и польские влияния — например, на Брянщине или Смоленщине.

Не стоит путать эту фамилию с «Худов»: Худовец — более поздняя по происхождению, она не могла возникнуть раньше XV–XVI века, когда в обиход вошли топонимические прозвища. В документах XIX века носители фамилии Худовец встречаются в основном среди крестьян и мещан Могилёвской и Киевской губерний. Таким образом, предки современного Худовца — скорее всего, крестьяне или ремесленники, переселившиеся в город из небольшого поселения, название которого уже сегодня может быть утрачено.