Фамилия Хунтузиди — редкий пример греческого по происхождению родового имени, которое бытует в русском языке. Её выдают характерные финальные элементы: окончание -иди и основа, не имеющая славянских корней. По модели образования это типичная греческая фамилия на -иди (или -ди), распространённая у понтийских греков. Суффикс -иди в греческой ономастике — аналог русского -ов/-ев: он указывает на принадлежность («сын такого-то»). Таким образом, любой носитель фамилии Хунтузиди — потомок человека, которого звали Хунтуз или Хунтузис.

С основой сложнее. В греческом языке нет прямого слова «хунтуз» или «хунтузи». Скорее всего, это русифицированная или искажённая запись греческой фамилии Χουντουζίδης (Хундузидис). В таком случае корень восходит к турецкому или анатолийскому прозвищу. В тюркских языках есть слово «konduz» — «бобр» (в диалектах — «хундуз»). Прозвище «Бобр» могло достаться либо человеку с пышными усами или бородой, либо зверолову, либо кузнецу, работавшему с бобровым мехом. Версия правдоподобна, потому что греки Причерноморья веками жили в окружении тюркских народов и заимствовали бытовые прозвища.

Есть и более прямая версия: в турецком языке есть слово «huntuz» (редкое, диалектное), означающее «упрямец» или «грубиян». Если так, то первый Хунтуз получил фамилию по характеру, и это объясняет, почему корень не встречается в христианских святцах — он не церковный, а бытовой.

Географически фамилия привязана к северному Причерноморью: Крым, Одесская область, Краснодарский край, а также к греческим общинам Грузии. После депортаций греков из Крыма в 1944 году и из Закавказья в 1949–1950-х носители фамилии расселились по югу России и Украины. Встречаемость фамилии крайне низкая — она сохранилась в основном в среде понтийских греков, и её носители в России часто уже не помнят греческого языка, но фамилия остаётся маркером происхождения.

Написание «Хунтузиди» — результат адаптации под русскую графику. В оригинале ударение, скорее всего, падает на последний слог: Хунтузиди́. В русском быту ударение может смещаться на второй или третий слог, что не меняет сути: это фамилия, которая рассказывает о предке-понтийце, носившем тюркское прозвище, и о переселениях целого народа.