Фамилия Хвищун — одна из тех, что сразу выдают южнорусское или украинское происхождение. Она образована с помощью суффикса -ун, который в восточнославянских языках активно использовался для создания прозвищ по действию или характерному признаку. Сравните: крикун, молчун, бегун. В основе фамилии лежит глагол «хвистать» или «хвищáть» — диалектный вариант литературного «хлестать», «свистеть», «бить с размаху». В украинском языке слово «хвищати» означает «стегать», «хлестать», а также «свистеть» (например, о ветре). Таким образом, Хвищун — это человек, который хлещет, стегает, или же тот, кто издаёт резкий, свистящий звук.

Учитывая региональную привязку, фамилия чаще всего встречается в западных и центральных областях Украины, а также в прилегающих районах России (Курская, Белгородская области) и в среде украинских переселенцев на Кубани. Здесь она могла закрепиться как прозвище пастуха, который погонял скот хворостиной, или же мастера, работающего с гибкими прутьями (корзинщика, плетельщика). Вторая версия связывает прозвище со свистом: Хвищуном могли назвать человека, который громко и пронзительно свистел — пастуха, лесника или просто обладателя такой привычки.

Модель образования без патронимического суффикса (-ов, -ин) указывает на то, что фамилия закрепилась в своей прозвищной форме, а не через отчество. Такое характерно для украинской ономастической традиции, где фамилии на -ун, -ак, -ук часто становились родовыми именами без дополнительного оформления. В русской среде аналогичная фамилия могла бы звучать как Хвистунов (от «хвист» — диалектный вариант «хвост»), но Хвищун сохранила исходную глагольную основу.

Встречаются варианты написания — Хвищун, Хвыщун, что связано с передачей звука «и» через «ы» в некоторых говорах. Фамилия не является аристократической или дворянской — она принадлежит к пласту народных прозвищ, которые давали по ремеслу, поведению или внешней примете. Носители фамилии Хвищун — потомки людей, которых в старину отличала либо резкость движений, либо звонкий голос, либо привычка работать с хворостом и лозой.