Фамилия Хвоичкина — женская форма фамилии Хвоичкин. Её основа — слово «хвоя», то есть иголки хвойных деревьев. Но связь с лесом здесь не прямая, а скорее прозвищная или профессиональная.

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища Хвойка. Так в северных и центральных губерниях России могли называть человека, который жил в густом ельнике или сосновом бору, либо занимался заготовкой лапника. В некоторых говорах «хвойкой» называли также особый сорт пива, которое варили с добавлением сосновых почек или шишек, — отсюда могло пойти прозвище любителя или изготовителя такого напитка.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хвоичкин — сын Хвойки. Уменьшительная форма Хвойка (а не Хвоя) говорит о том, что прозвище могли дать молодому или невысокому человеку, либо оно носило ласкательный оттенок. Сама фамилия Хвоичкин — вариант с чередованием «й/ич»: от Хвойка через форму Хвоичка.

Встречаемость фамилии невысокая, но устойчивая в регионах Русского Севера и Поволжья — там, где хвойные леса были основным ландшафтом. В писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются крестьяне Хвойки из Архангельского и Вологодского уездов, что подтверждает северное происхождение прозвища.

Менее правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «хвоич» — так в некоторых местах называли задиристого, колючего в общении человека. Но это значение локальное и документально не закреплено, поэтому версия с лесным промыслом выглядит убедительнее.