Фамилия Кифиров — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с профессией или внешностью, а с характером. В центре здесь корень «кифир» — искажённое просторечное «кефир». В русских говорах, особенно южных и украинских, так называли не только напиток, но и кислое, прокисшее молоко или сыворотку, а также — в переносном смысле — вялого, скучного, «кислого» человека. Прозвище Кифир могли дать тому, кто постоянно жаловался, ходил с недовольным лицом или, напротив, отличался медлительностью и апатией. В некоторых диалектах слово «кифир» означало ещё и «пустомеля» или «болтун», что добавляет версии про характер ещё один оттенок.

Модель образования проста и прозрачна: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Кифира» или «из рода Кифира». Это типичная патронимическая фамилия, каких тысячи, но с необычной, бытовой основой. В отличие от фамилий, образованных от канонических имён (Иванов, Петров), Кифиров стоит в ряду прозвищных фамилий, которые в XVIII–XIX веках закреплялись за крестьянами и мещанами. Дворянской или купеческой эта фамилия быть не могла: слишком просторечный и даже уничижительный корень.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине. Встречается в воронежских, ростовских, краснодарских архивах. Написание устойчивое, без вариантов (Кифиров, а не Кефиров), что говорит о том, что прозвище записывали на слух, и оно закрепилось в той огласовке, которая была в местном говоре. Интересно, что в некоторых переписях XIX века фамилия могла писаться через «е» — Кефиров, но со временем «и» вытеснила «е» как более привычное для русского уха.

Никакой связи с тюркскими или греческими корнями (несмотря на созвучие с греческим именем Кифир) у фамилии нет. Её происхождение — чисто бытовое, народное, и это как раз тот случай, когда фамилия говорит о предке не как о ремесленнике или служивом, а как о человеке с яркой, пусть и нелестной, чертой характера.