Фамилия Кимсо — редкий случай, когда русская по форме фамилия с большой вероятностью имеет нерусские корни, причём не тюркские и не финно-угорские, а, скорее всего, корейские или кавказские. В русском языке она выглядит как искусственная или застывшая основа, потому что не содержит привычных фамильных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -о типично для украинских или белорусских фамилий (как Коваленко, Шевченко), но основа Кимс- для славянских языков чужда.

Самая вероятная версия — происхождение от корейской фамилии Ким (김) с добавлением русского суффикса -с- и окончания -о. В XIX — начале XX века в русских документах корейские фамилии нередко русифицировали: к основе прибавляли -ов/-ев, -ин или просто оформляли на славянский лад. Вариант Кимсо мог возникнуть при записи корейца по имени или прозвищу Ким, к которому добавили -со как часть фамилии (например, Ким Со — где Со — второй слог имени или кланового имени). Подобные гибриды встречаются у корейцев, переселившихся на Дальний Восток и в Среднюю Азию.

Вторая гипотеза — кавказское происхождение. В осетинском, чеченском или ингушском языках есть фамилии, оканчивающиеся на -со (например, Дзугкоев, но с усечением). Кимсо могло образоваться от имени Ким (у осетин — мужское имя, сокращение от Ким — «Коммунистический Интернационал Молодёжи», популярное в советское время) с добавлением суффикса -со, который в осетинском языке указывает на принадлежность к роду или местности. В этом случае фамилия — советского происхождения, что объясняет её редкость и «неклассический» вид.

Также не исключена версия, что Кимсо — это искажённая запись фамилии Кимцов или Кимсов, где конечное -ов отпало при переписи или из-за диалектного произношения. Но эта гипотеза слабее: если бы исходная форма была Кимсов, она бы сохранилась в документах, а не превратилась в Кимсо.

География фамилии сегодня — единичные носители в России, Казахстане и Узбекистане, что подтверждает её миграционный характер. Сословно предки, скорее всего, были крестьянами или рабочими: корейские переселенцы в основном занимались земледелием, а кавказские носители советских имён — колхозниками или заводскими работниками. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Итог: перед нами, вероятно, русифицированная корейская фамилия, реже — советская осетинская. Точное происхождение можно установить только по семейным архивам, но оба варианта указывают на XX век и на то, что предки были людьми, далёкими от столиц — либо дальневосточными переселенцами, либо горцами.