Фамилия Киншетбаев — редкий случай, когда разбор начинается не с корня, а с суффикса. Формант -ев указывает на русскую модель патронимии: так оформляли фамилии от основ на мягкий согласный или на -й. Но сама основа — Киншетбай — явно тюркская, скорее всего казахская или башкирская. Следовательно, перед нами пример адаптации тюркского имени к русской фамильной системе: сначала было личное имя или прозвище Киншетбай, а затем, при контакте с русской администрацией, к нему добавили типовой суффикс принадлежности.

Имя Киншетбай составное. Первая часть — «киншет» — может восходить к казахскому «кiншiт» или диалектному «киншет», что связано с глаголом «кiншiту» — обижать, задевать, уязвлять. В таком варианте Киншетбай — охранительное имя, которое давали ребенку, чтобы отвести от него зло: буквально «обижай-бай» или «обиженный богач». Это типичная для тюрков практика: давать ребенку имя с негативным оттенком, чтобы обмануть злых духов. Вторая часть — «бай» — означает «богач, хозяин, господин» и часто служила титульным компонентом в именах знати или зажиточных людей.

Есть и более прозаичная версия. В некоторых тюркских говорах «киншет» могло быть искажением слова «кеншет» — «младший, меньшой». Тогда Киншетбай — «младший бай» или «бай-младший», что указывало на положение в семье или на возрастное отличие от старшего брата. Эта версия менее популярна, но лингвистически возможна, особенно если учесть, что в устной речи звуки могли смешиваться.

Географически фамилия привязана к западному Казахстану и прилегающим областям России — Астраханской, Оренбургской. Встречается она крайне редко, что говорит о локальном происхождении от конкретного рода. Носители фамилии — потомки того самого Киншетбая, который, судя по имени, мог быть либо человеком с непростым характером (от «обижать»), либо младшим сыном в состоятельной семье. Сословно предки, скорее всего, относились к казахам-скотоводам, а фамилию закрепили в документах в XIX — начале XX века, когда массово учитывали кочевое население.