Фамилия Кипотир — редкая и неочевидная. Если отбросить интуицию, которая тянет искать в ней греческие корни (Кипр, кипарис), то логичнее всего разбирать её как сложение двух основ: «кип» и «отир». Первая часть восходит к глаголу «кипеть» или существительному «кипень» (пена, накипь), вторая — к «отирать» (вытирать, обтирать). В сумме получаем прозвище человека, занятого какой-то «мокрой» работой, связанной с кипятком, варкой или выпариванием: возможно, солевар, пивовар, мыловар или работник на кухне, который постоянно снимал пену и вытирал котлы.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. В русских фамилиях редко встречается чистая глагольная основа без суффикса -л- (ср. Кипятильников, Кипятков). Кипотир — это скорее южнорусское или украинское образование, где прозвища часто строились по схеме «глагол в повелительном наклонении + объект» (Держидерево, Вернигора, Убейвовк). Но здесь обе части — смысловые, и повелительного наклонения нет: «кипеть» + «отирать». Это наводит на мысль о профессиональном термине или даже о прозвище, данном за манеру работы — быстро и с паром.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу бывшей Российской империи. Встречается в документах по Подольской губернии и Херсонщине, единичные записи есть в казачьих реестрах. В центральных великорусских губерниях она почти неизвестна. Это косвенно подтверждает версию о происхождении из среды ремесленников или мелких промышленников, а не крестьян-землепашцев.

Альтернативная версия — искусственное происхождение. В семинарской среде фамилии нередко сочиняли из греческих или латинских корней, но Кипотир не похожа на типичные семинарские: те обычно оканчивались на -ский, -ов или имели явный античный оттенок (Киприанов, Кипарисов). Скорее всего, это именно бытовое прозвище, которое закрепилось за одним родом и не получило широкого распространения.

Сегодня носителей фамилии — единицы, в основном на Украине и в южных областях России. Фамилия не попала в массовые справочники, что делает её подлинной редкостью: она не угасла, но и не «размножилась» за счёт случайных совпадений.