Фамилия Кишонус — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её окончание -ус сразу указывает на нерусскую, скорее всего, балтийскую или польскую основу. В русской среде такие фамилии обычно появлялись через полонизированные формы или через прибалтийские земли (Латвия, Литва), где суффикс -ус характерен для фамилий латышского происхождения. Если разбирать корень, то первая часть «Кишон-» может восходить к литовскому или латышскому слову kišti («толкать», «втыкать») или kišonas — вариант имени, прозвища. Однако в славянских языках есть и близкое слово «киш» (каша, месиво), что могло дать прозвище «Кишон» — человек, который готовит или любит кашу, либо же неуклюжий, «размазня».

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища или имени Кишон (Kiszon) с добавлением типичного для польско-литовской ономастики окончания -ус, которое в русской передаче закрепилось как -ус. Такая модель встречается у шляхетских и мещанских фамилий на территории бывшей Речи Посполитой. В пользу этого говорит и то, что фамилия не имеет русского суффикса -ов/-ев, что исключает её крестьянское происхождение из центральной России. Носители Кишонус, скорее всего, предки — выходцы из западных губерний (Виленская, Ковенская, Гродненская) или из Латвии, где фамилия могла быть записана как Kišonus.

Словообразовательная модель проста: основа Кишон (личное имя или прозвище) + латышский/литовский патронимический суффикс -us, означающий «сын» или «принадлежащий». В польском варианте окончание могло бы быть -ski, но здесь мы видим именно балтийский след. Спорных версий немного: иногда пытаются связать с венгерским «киш» (маленький), но это натяжка, так как венгерские фамилии в русском языке обычно заканчиваются на -и или -ич, а не на -ус.

Из-за редкости фамилии точных данных о сословной принадлежности нет, но косвенные признаки (отсутствие русского суффикса, окончание -ус) указывают на мещан или мелкую шляхту, а не на крепостных крестьян. В современной России носители Кишонус встречаются единично, в основном на северо-западе и в Москве, что подтверждает миграцию из Прибалтики. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать корни в метрических книгах Литвы или Латвии конца XIX века.