Фамилия Кисиныкина звучит на слух почти как загадка: длинная, с повторяющимися слогами, она сразу приковывает внимание. Однако её разбор, на удивление, прозрачен, если знать одну особенность русских фамилий. Скорее всего, перед нами не самостоятельная фамилия, а женская форма от мужской фамилии Кисиныкин. В русской традиции фамилии на -ин образуют женский вариант с окончанием -а: Иванов — Иванова, Кисиныкин — Кисиныкина. Поэтому, чтобы понять корень, нужно смотреть на мужской вариант.

Мужская фамилия Кисиныкин строится по типичной модели: основа + суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность: «чей?» — «кисиныкин», то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Кисиныка. А вот что такое «Кисиныка» — здесь и кроется главный интерес. Слово «кисиныка» в современном русском языке не встречается, но оно легко раскладывается на корень «кис-» и суффикс -ын-ик- (или -ык-). Корень «кис-» отсылает к глаголу «киснуть», то есть становиться кислым, скисать, или к прилагательному «кислый». В диалектах и народной речи «кислый» могло означать не только вкус, но и характер: вялый, унылый, плаксивый человек. В некоторых говорах «кисляй» или «кислыш» — прозвище для того, кто вечно недоволен или жалуется.

Суффикс -ык-/-ик- в русских прозвищах часто придаёт оттенок уменьшительности или, наоборот, пренебрежения (сравните: «дурак» — «дурачина», «кислый» — «кислина»). Таким образом, Кисиныка — это, вероятно, прозвище, образованное от «кислый» с помощью суффикса, означающего «носитель признака». Человек мог получить такое прозвище за кислое выражение лица, медлительность или склонность к хандре. Впрочем, не исключён и более конкретный бытовой корень: в некоторых регионах «кислицей» называли дикую яблоню или щавель, а «кисиныка» могло быть шутливым прозвищем любителя кислой пищи или того, кто занимался закваской капусты.

В географическом плане фамилия Кисиныкин (и её женская форма) очень редка. Она не встречается в списках распространённых фамилий центральной России и, скорее всего, имеет локальное происхождение — возможно, в одном из сёл Поволжья или северных областей, где диалектная лексика сохраняла такие формы. Носители фамилии, вероятно, были крестьянами или мещанами, и фамилия закрепилась в документах относительно поздно, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам. Однокоренных фамилий — Кислов, Кислых, Кисляков — много, но Кисиныкин выделяется именно редкостью суффикса, что делает её своеобразным диалектным «экспонатом».