Фамилия Кисницкая — вариант женского рода, а мужская форма, Кисницкий, встречается реже и звучит как книжная, шляхетская. На это указывает суффикс -ский, который в восточнославянской традиции чаще всего получали дворяне по названию своего поместья или выходцы из западнорусских земель. Однако не стоит торопиться приписывать носителям фамилии благородное происхождение: в XIX веке суффикс -ский стал массово появляться у духовенства и крестьян, особенно в южных и западных губерниях, где его воспринимали как более «красивый».

Корень Кисниц- почти наверняка указывает на топоним — название села, деревни или урочища Кисница, Кисники, Кисничи. Такие названия могли возникнуть от речки Кисница (вода с кислым привкусом из-за болотных или известковых отложений) или от прозвища Кислый, Кисница — человека угрюмого, «кислого» нрава. В польской ономастике есть фамилия Kiśnicki, которая могла быть русифицирована в Кисницкий: корень kiś- означает «кислый» или «кисель», что тоже ведёт к прозвищу.

Географически фамилия Кисницкая привязана к западным областям: чаще всего она встречается в Беларуси, на Украине (особенно в Волынской и Ровенской областях) и в приграничных районах России. В польских метриках XVII–XVIII веков можно найти записи о шляхтичах Кисницких герба «Равич» или «Любич», но документальных подтверждений их связи с современными носителями фамилии нет. Возможно, часть Кисницких — потомки православных священников, которым после реформы духовных училищ давали фамилии по названиям сёл, где они служили.

Есть и менее очевидная версия: корень Кисн- мог быть вариантом от Косн- (косный, медлительный) или от диалектного киснуть в значении «бездельничать, киснуть от безделья». Но она слабая, потому что в фамилиях на -ский редко встречается глагольная основа без суффикса. Правдоподобнее всего, что предок носительницы фамилии либо жил в деревне с «кислым» названием, либо получил прозвище за свой характер, а потом его дети оформили фамилию по польскому образцу.