Фамилия Кисняркина — женская форма мужской фамилии Кисняркин. Она образована по классической русской модели с суффиксом -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: «дочь или жена Кисняркина». Сама основа фамилии — Киснярка — звучит необычно и заставляет задуматься о её происхождении.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или мирское имя Киснярка. Слово «кислый» в русских говорах имело не только прямой вкусовой смысл, но и переносный — «недовольный, хмурый, плаксивый человек». Суффикс -яр- в данном случае мог выполнять роль усилителя: Киснярка — это тот, кто постоянно «киснет», ноет или капризничает. В русской ономастике такие прозвища по характеру были распространены: например, Кисляк, Кислов, Кислин. Фамилия Кисняркин — редкий вариант с дополнительным суффиксом, что делает её уникальной.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с географическим названием. В некоторых регионах России, особенно в Поволжье, есть топонимы вроде Киснярка (например, речка или овраг). В таком случае предок мог получить фамилию по месту жительства: «Кисняркин» — выходец из местности Киснярка. Однако эта версия слабее, так как фамилии на -ин от топонимов встречаются реже, чем от прозвищ.

Фамилия Кисняркина — редкая. В открытых базах данных она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в одной-двух областях Центральной России. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давали по поведению или внешности. Сегодня эта фамилия — живая редкость, сохранившая в себе старинное диалектное слово.