Фамилия Кивисепп ведет свое начало от двух эстонских слов: kivi – «камень, косточка» и sepp – «кузнец». Таким образом, она указывает не только на ремесло предка, но и его физическую форму: вероятно, он был высоким, крепким, сильным человеком.