Фамилия Кизино — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии происхождения. Судя по форманту, перед нами типичная «географическая» фамилия на -о, характерная для северных и центральных областей России. Такие фамилии (сравните: Ростово, Болдино, Прохорово) обычно указывали на выходца из конкретного населённого пункта — села или деревни Кизино. И такие топонимы действительно существуют: деревни с названием Кизино встречаются в Костромской, Вологодской, Кировской и некоторых других областях. Человек, переселившийся из такого места, получал прозвание «Кизино», которое затем закреплялось за его потомками как фамилия.

Если отбросить топонимическую версию, придётся разбирать корень «киз-». В русских говорах слово «киза» имело несколько значений: так могли называть киску, кошку (ласкательное), а в некоторых диалектах — бранное прозвище для капризного или плаксивого человека. В этом случае фамилия образовалась бы по модели «Киза → Кизин → Кизино» с помощью патронимического суффикса -ин, а окончание -о указывало бы на форму множественного числа или принадлежность к роду (сравните: Чухлома — Чухломин, но фамилия на -о в такой модели встречается реже). Однако эта версия менее убедительна: фамилий на -о от прозвищ почти не образуют, а вот от названий деревень — сплошь и рядом.

Есть и экзотическая гипотеза, связывающая фамилию с тюркским словом «кизил» (красный) или «кызыл» (золото), но она натянута: для перехода «кызыл» в «кизино» нет фонетических оснований, и фамилия не фиксируется в южных регионах, где такие корни были бы естественны.

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение: предок носителя фамилии Кизино был крестьянином или посадским человеком, который происходил из одной из многочисленных русских деревень Кизино. Фамилия недворянская, нестарая — такие «топонимические» фамилии массово закреплялись за крестьянами после отмены крепостного права в 1861 году, когда бывшим помещичьим крестьянам давали фамилии по месту прежнего жительства. Встречаемость фамилии сегодня невысока, что подтверждает её локальное происхождение.