Фамилия Клавакина — женская форма, а её мужской вариант — Клавакин. На первый взгляд основа кажется необычной, но это типичная русская фамилия, образованная с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Клавакин, то есть сын или потомок Клаваки. В центре внимания — прозвище или имя Клавака.

Самое правдоподобное объяснение корня — диалектное слово «клавака». В южнорусских и украинских говорах так могли называть неуклюжего, неловкого человека, того, кто «клавается» — кланяется, сутулится, ходит согнувшись. В этом случае прозвище давали по характерной походке или осанке. Есть и более редкая версия: в некоторых местностях «клавакой» звали того, кто постоянно клянчит, канючит (от глагола «кланяться» в смысле «просить, унижаться»). Оба значения укладываются в типичную модель русских прозвищ, описывающих внешность или поведение.

Суффикс -ак- в основе (Клав-ак-а) — распространённый способ образования прозвищ в XVI–XVII веках. Сравните: Гуляка, Вертяка, Коряка. То есть Клавака — это человек, которого выделили по действию или качеству: кланяющийся, сутулый или, реже, надоедливый проситель. Фамилия фиксируется в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине, что подтверждает южнорусский диалектный след.

Мужская форма Клавакин встречается редко, но не является единичной. В дореволюционных переписях её носители — преимущественно крестьяне и мещане, что логично: прозвищные фамилии редко поднимались в высшие сословия. Фамилия не имеет отношения к имени Клавдий (это отдельная, книжная традиция) — здесь чисто прозвищная народная основа.