Фамилия Клавцане — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет латышские или, шире, балтийские корни. В русском языке она выглядит как застывшая форма, скорее всего, родительного падежа от мужской латышской фамилии Клавцанс или Клавцанис. Такое окончание на -не (ср. Бирзне, Лиепине) характерно для женских фамилий в Латвии, но в русской передаче могло закрепиться как неизменяемое.

Основа фамилии — «клавц-» — восходит к латышскому глаголу «klaukt» (стучать, колотить) или его диалектным формам. В латышском языке есть слово «klauķis» — стук, а также прозвище для человека, который громко стучит, работает с молотком или просто обладает резкими, «стучащими» манерами. Таким образом, первый носитель фамилии мог получить прозвище Клавцанс за профессию кузнеца, плотника или за неуклюжесть, с которой он что-то ронял или стучал.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: связь с литовским «klavėti» (клониться, гнуться). Если так, то прозвище могло относиться к человеку сгорбленному, сутулому. Однако фонетически форма «Клавцане» ближе именно к латышскому ареалу с его характерным окончанием.

С точки зрения словообразования, суффикс -ан- в латышских фамилиях часто образует отчества или прозвища от глагольных основ (ср. Dzintans — от dzintars, янтарь). Здесь же мы видим основу, производную от глагола действия. Географически фамилия Клавцане могла возникнуть в Латгалии или приграничных с Латвией районах Псковской области, где было сильное латышское влияние.

В дореволюционной России такую фамилию могли носить крестьяне или мещане латышского происхождения, переселившиеся на восток. Сословной привязки нет: в Латвии фамилии на -анс встречались и у крестьян, и у горожан. Сегодня Клавцане — редкая фамилия, и её носители, скорее всего, потомки тех, кто когда-то «стучал» молотом в своей кузнице или на стройке.