Фамилия Клистиркин — редкий случай, когда основа прозвища вызывает у носителей языка почти рефлекторное смущение. Однако происхождение здесь прозаичнее, чем кажется на первый взгляд. Разбираем по порядку.

В основе лежит слово «клистир» — это устаревшее название медицинской процедуры промывания кишечника (современный аналог — клизма). Слово пришло в русский язык из немецкого (Klistier) или напрямую из латыни (clyster) через западноевропейскую медицину XVIII–XIX веков. Прозвище Клистир могли дать либо лекарю, который часто ставил клизмы, либо самому пациенту, которому эта процедура требовалась постоянно. В народе такие прозвища нередко закреплялись за фельдшерами, цирюльниками или больными людьми с хроническими запорами.

Суффикс -кин указывает на принадлежность: чей? — Клистиркин. Это типичная русская патронимическая модель, где притяжательный суффикс -ин (после основ на -а, -я) добавляется к прозвищу, оканчивающемуся на -а: Клистира → сын Клистиркин. В быту прозвище могли произносить как «Клистира», отсюда и форма на -ин, а не на -ов.

В ономастике известна параллельная фамилия Клистин (без «р») — она могла возникнуть от того же корня через упрощение или от другого слова (например, «клист» — диалектное название какого-либо инструмента). Но Клистиркин сохраняет «р» и медицинскую отсылку.

Сословно фамилия скорее всего крестьянская или мещанская. В дворянской среде такие прозвища не приживались из-за сниженного, бытового оттенка. Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных губерниях России, где была развита земская медицина и фельдшерские пункты.

Никакой неприличной подоплёки в фамилии нет — только история медицины и народной словесности. Если ваш предок носил прозвище Клистир, он с высокой вероятностью имел отношение к лечению, пусть и самому простому, доантибиотиковому.