Фамилия Клиско звучит так, словно её носитель когда-то что-то «клискал». И это не шутка: в основе фамилии лежит глагол, который в диалектах означал «стучать, щёлкать, звенеть». В псковских и тверских говорах «клискать» — это издавать звонкий звук, щёлкать языком или зубами. Человек, получивший такое прозвище, мог быть говорливым, любителем пощёлкать семечки или, наоборот, молчуном, который выразительно щёлкал в разговоре. В любом случае, прозвище Клыск или Клиско было звукоподражательным, как и многие древние прозвища.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна. Суффикс -к- в основе «Клиск-» указывает на лицо, названное по действию (ср. «визг» → «визжать» → Визгун, но здесь «клиск» — тот, кто клискает). А окончание -о — типичное для украинских и южнорусских фамилий, обозначающих лицо по прозвищу (как Коваль, Козак, Лысенко, но с другим суффиксом). Фамилия Клиско могла возникнуть как на Украине, так и в южных областях России, где окончание «-о» в фамилиях — обычное дело. География фамилии это подтверждает: наибольшая концентрация носителей — в Харьковской, Сумской и Белгородской областях.

Версия, связывающая фамилию с личным именем Клим (от Климент — «милостивый»), менее вероятна. Для такого перехода нужна была бы форма «Климско» или «Клименко», а суффикс «-ск-» в фамилиях на «-о» встречается редко. Скорее всего, Клиско — это прямое прозвище, а не производное от имени.

Есть и третий, более редкий вариант: в польском языке слово «kliska» означает «пятно, крапинка». Если предки носителя фамилии жили на землях бывшей Речи Посполитой (современная Западная Украина или Беларусь), то прозвище могло относиться к человеку с веснушками или рябому. Но для восточнославянской традиции версия со звукоподражательным глаголом выглядит убедительнее — она проще и логичнее вписывается в модель народных прозвищ.

Фамилия Клиско не относится к дворянским или книжным — это типичная фамилия крестьянского или казацкого происхождения. Её носитель с большой вероятностью был простым человеком, которого в деревне знали по характерной привычке щёлкать или по громкому голосу. В документах XVII–XVIII веков такую фамилию можно было бы встретить среди реестровых казаков или мещан Левобережной Украины.