В основу фамилии Клисова легло церковное имя Климент. Мужское крестильное имя Климент в переводе с греческого языка означает «милостливый», по другой версии - «виноградная лоза». В основу же данной фамилии легла уменьшительная форма имени – Клиш или Клис. Скорее всего, основатель рода Клисовых был человеком из простого сословия. Не исключено, что фамилия Клисова образовалась от прозвища Клис. Согласно одной из версии, оно происходит от русского глагола «клести, клещить», который имеет значение «щемить, ущемлять, гнести, жать, сжимать, тискать, сдавливать» или украинского слова «клесачка» - «сапожный инструмент для разглаживания швов». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Клис относилось к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Так, Клисом могли называть плотника или сапожника. Менее вероятно, что прозвище Клис происходит от топонима Клис — крепость недалеко от Сплита (Далмация). Отсюда ускоки — славяне-беглецы от турецкого ига — предпринимали вылазки на турок, борьба с которыми и была их главной целью. Клис был взят турками, несмотря на мужественную защиту ускоков. Возможно, основатель рода Клисовых был выходцем из этого города. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Клисовых можно лишь на основании генеалогических исследований.