Фамилия Клютченя звучит необычно, и её разбор — хороший пример того, как прозвище, данное за характер, превратилось в наследственное имя. В основе лежит древнерусское слово «клюка», означавшее «крюк», «изогнутая палка», а в переносном смысле — «хитрость», «уловка» или «крючкотворство». Человек, которого прозвали Клюкой или Ключом, скорее всего, слыл хитрецом, любителем спорить и добиваться своего обходными путями. В современных говорах «клюка» могла означать и скупого, прижимистого человека — того, кто «гнёт свою линию».

Словообразовательная модель здесь редкая для русских фамилий. Суффикс -еня характерен для белорусской и западнорусской ономастики. В белорусском языке этот суффикс образует фамилии от личных имён и прозвищ (например, Астапеня, Каваленя, Козленя). Таким образом, Клютченя — это, скорее всего, белорусская или западнорусская фамилия, возникшая на территории современной Беларуси или Смоленщины. Основа «Клютч-» — это фонетический вариант от «клюк-» или «ключ-»: в говорах звук «к» перед гласным мог смягчаться, а «ч» заменять «к» (сравните: ключ и клюка — однокоренные слова, означающие «загиб»).

Если обратиться к аналогиям, то фамилии Клюкин, Ключников, Ключарёв встречаются чаще и понятнее по смыслу: они указывают на ремесло (ключник) или на прозвище по характеру. Клютченя стоит в том же ряду, но сохранила архаичную и региональную форму. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такая модель не описывается как типично русская, что подтверждает её западное происхождение. Носитель фамилии мог быть потомком человека, которого в деревне дразнили Клюкой или Ключом за изворотливость, а при переписи или в церковной книге записали как Клютченя — по белорусскому обычаю, с патронимическим суффиксом, означающим «сын Клюки».

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с профессией. «Ключник» — человек, ведающий ключами, кладовщик. Но форма Клютченя могла возникнуть как отчество от прозвища Ключник, где основа сократилась и изменилась. Однако эта гипотеза слабая: суффикс -еня редко присоединяется к названиям профессий напрямую. Гораздо правдоподобнее, что корень — чисто прозвищный, и фамилия означает «потомок хитрого человека».