Фамилия Коисниченко — один из тех редких случаев, когда корень слова почти не поддаётся однозначной этимологии, но сама модель образования говорит о многом. Суффикс -енко чётко указывает на украинское или южнорусское происхождение: в этой модели фамилии означали «сын» или «потомок» человека, чьё прозвище или имя легло в основу. То есть Коисниченко — буквально «сын Коисниченка», а тот, в свою очередь, «сын Коисника» или «Коисны».

Главная сложность — в основе «коисн-». В украинской и русской ономастике нет устойчивой лексемы с таким звучанием. Самая рабочая версия — искажение или диалектное произношение фамилии, образованной от прозвища, связанного с профессиональной деятельностью. Например, возможна связь с глаголом «коиснуть» (диалектный вариант «костынуть», «коситься» — смотреть косо, избегать), но это лишь догадка. Более правдоподобно, что перед нами вариант фамилии Косниченко или Косинченко, где «о» появилось под влиянием акающих говоров или просто при записи в документах: писарь мог записать на слух «Коисниченко» вместо «Косниченко». В таком случае корень «косн-» отсылает к слову «косный» (медлительный, неповоротливый) или к «коса» (инструмент, либо причёска, либо географический объект — коса на реке).

Если же отталкиваться от написания без «и» — Коисниченко могло возникнуть из личного имени или прозвища Коисник, которое, в свою очередь, является вариантом Койсник. В некоторых говорах «койсник» — человек, который «коится» (беспокоится, тревожится, от древнерусского «коити» — тревожить). Но это ещё более редкая версия.

Географически фамилия встречается в основном в центральных и восточных областях Украины, а также в приграничных районах России. Сословно, как и большинство фамилий на -енко, она принадлежала крестьянскому или казачьему сословию: такие фамилии часто фиксировали в реестрах Войска Запорожского и в метрических книгах сельских церквей. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Коротко: Коисниченко — украинская фамилия, образованная по патронимической модели. Корень, скорее всего, искажённый вариант «косн-» или «коисн-» от прозвища, связанного с внешностью, характером или ремеслом. Точное значение утрачено, но ясно, что предок носителя был человеком с характерной чертой, которую за ним закрепили в виде прозвища.