Фамилия Коханчиков — один из тех случаев, когда за привычным русским суффиксом -ов скрывается основа совсем не русского происхождения. Если отбросить окончание, остается корень «кохан-» и суффикс -чик-, который в русских фамилиях обычно указывает на профессию или характерный признак человека (например, Барабанщиков, Летчиков). Однако в данном случае «кохан» — это не профессия, а украинское слово, означающее «любимый», «возлюбленный». В украинском языке «коханий» — это прилагательное, а «кохан» — краткая форма, которая могла стать личным именем или прозвищем.

Фамилия образовалась по типичной модели: сначала на южнорусских или украинских землях появилось прозвище Кохан (ласкательное, возможно, так звали желанного ребенка или любимого мужа), затем к нему добавили уменьшительно-ласкательный суффикс -чик- (Коханчик — «маленький Кохан» или «сын Кохана»), и уже от этой формы возникла фамилия Коханчиков, то есть «потомок Коханчика». Такая цепочка — от прозвища через патроним на -ич/-чик к фамилии на -ов — характерна для выходцев из западнорусских и малороссийских губерний, которые затем переселялись в центральную Россию, где и закрепилась «великорусская» фамильная форма.

В отличие от более распространенных фамилий Кохан, Коханенко, Коханчук, форма Коханчиков встречается реже и указывает на то, что предок носителя, вероятно, был не просто «любимым», а именно «Коханчиком» — возможно, младшим сыном в семье или человеком, которого так ласково называли в окружении. Суффикс -чик- в фамилиях нередко прикреплялся к прозвищам, чтобы подчеркнуть молодость или зависимое положение, а затем застывал в родовом имени. Таким образом, этимологически Коханчиков — это «внук или потомок того, кого звали Коханчик», а исходный смысл прозвища — «любимый человек».