Фамилия Кокырлэ — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет явно нерусскую, скорее всего, молдавскую или румынскую основу. Встречается она в основном в Молдавии и на юго-западе Украины, среди потомков переселенцев из Бессарабии. Её происхождение напрямую связано с географическим названием или прозвищем, а не с крестильным именем.

Словообразовательная модель здесь необычна для славянских фамилий. Окончание -э (вместо привычного -а или -о) — это румынский/молдавский артикль, который в фамилиях часто прирастает к основе. Сама основа «Кокырл» восходит к румынскому слову «cocârlă» (кокырлэ), что означает «кривой», «изогнутый», «согнутый». В переносном смысле так могли назвать человека сгорбленного, сутулого или, наоборот, хитрого, «изворотливого». Вторая версия, менее вероятная, — связь с топонимом: в Молдавии есть село Кокырлэнь, и фамилия могла образоваться от названия места жительства.

По структуре фамилия Кокырлэ стоит в ряду таких же «румынизированных» фамилий, как Кожокарь (кожевник), Пэдурарь (лесник) или Кэрэуш (возчик). Однако, в отличие от них, Кокырлэ не указывает на профессию, а фиксирует внешнюю или характерную черту конкретного человека — прозвище, данное при жизни. В российской переписи XIX — начала XX века такие фамилии часто записывали на слух, поэтому в документах можно встретить варианты «Кокырло», «Кокырла» или даже «Кокырлов» (при русификации). Но исконная форма — именно Кокырлэ, с ударением на последний слог.

Таким образом, носитель фамилии Кокырлэ почти наверняка происходит из молдавской или бессарабской среды, а его предок получил прозвище «Кривой» или «Согнутый» — прямое, без обиняков, как это было принято в сельской ономастике.