Фамилия Комащенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках распространилась по всей Левобережной Украине и позже проникла в южнорусские области. Суффикс -енко (с ударением на последний слог) изначально означал «маленький», «сын» или «потомок»: Комащенко — буквально «сын Комаща» или «потомок Комаща». Такие фамилии образовывались от прозвищ, профессий или личных имён.

Основа фамилии — Комащ — скорее всего, восходит к слову «комар». В славянской антропонимии прозвища, связанные с насекомыми, были распространены: они могли указывать на внешность (худой, пронзительный, назойливый, как комар), на профессию (комары водились в болотистых местах, где жили люди) или на особенность характера. Реже встречается версия, что Комащ — это видоизменённое личное имя Кома (уменьшительное от Комар) с добавлением суффикса -щ, что делало прозвище более экспрессивным.

По сравнению с фамилиями Комаров или Комаревич, Комащенко имеет чёткую украинскую привязку: она почти не встречается в северных и центральных русских регионах, зато типична для Полтавщины, Черниговщины и соседних областей. В XIX веке носители фамилии в основном были крестьянами и казаками; дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. География подсказывает, что предки Комащенко жили в местах с влажным климатом и обилием комаров — что косвенно подтверждает прозвищную версию.

Словообразовательный разбор прост: корень комащ-, суффикс -енко. Ударение в фамилии, как правило, падает на последний слог: Комаще́нко. Встречается также вариант с ударением на второй слог (Кома́щенко), но он менее распространён и может быть результатом русификации. Если говорить о социальном контексте, то фамилия не несёт следов знатного происхождения — это типичная «народная» фамилия, образованная в ту эпоху, когда украинские крестьяне и казаки массово получали фамилии по прозвищам.