Фамилия Комлончук — редкий случай, когда модель словообразования почти полностью раскрывает историю, а точное значение корня ускользает. Основа здесь — «Комлон-», а суффикс «-чук» однозначно указывает на западноукраинское или белорусское происхождение: в этих регионах «-чук» означал «сын» или «маленький», то есть носитель фамилии — потомок человека по прозвищу Комлон.

Самое сложное — сам корень. В украинских и польских говорах слова «комлон» в прямом значении нет. Вероятнее всего, это искажённая или диалектная форма. Можно предположить, что в основе лежит польское «komło» (короткое бревно, чурбан) или «komol» (безрогий, комолый). Если так, то прозвище Комлон могли дать либо крепкому, коренастому человеку, либо тому, кто работал с деревом, либо (по аналогии с «комолым») — безобидному, «безрогому» человеку, не склонному к драке. Вторая версия — от личного имени, например, уменьшительного от польского «Klemens» (Клеменс) через форму «Klemło» — но это фонетически менее убедительно.

Географически фамилия тяготеет к западу Украины (Волынь, Подолье) и юго-востоку Польши (Люблинское воеводство). В этих местах суффикс «-чук» особенно распространён. Социально предки Комлончуков, скорее всего, были крестьянами или мелкими ремесленниками — в шляхетской среде такие «патронимические» фамилии на «-чук» встречались редко, они оставались маркером простого сословия.

Написание фамилии устойчивое: через «о» в первом слоге. Вариант «Комленчук» в документах почти не встречается, что подтверждает связь именно с «комолым» или «комло», а не с каким-либо именем на «-ен».